Орієнтація на використання екологічно нейтрального транспорту наразі є однією з засад філософії компанії. FlixBus в перспективі декількох років має намір розпочати пасажирські перевезення на автобусах з електричним приводом. Про це йшлося на пресконференції у Мюнхені, присвяченій 10-річчю роботи компанії.
Зокрема, співзасновник і генеральний директор Flix Андре Шваммляйн представив ескіз транспортного засобу під робочою назвою E-bus. Прототип електробуса розробляється в співпраці з Daimler. Очікується, що машина буде готова за 4 роки.
Андре Шваммляйн відзначив, що дотримання екологічних аспектів і зниження рівня викидів в атмосферу «є однією зі складових ДНК компанії».
На заході в Мюнхені FlixBus також показав автобус, який працює на біопаливі, виготовленому з ріпака. З вересня 2022 року такі автобуси працюють на маршруті FlixBus у Франції між Брестом і Греноблем. Це найдовша в Європі автобусна лінія, на якій автобуси на 100% працюють на біопаливі.